全国各级交通运输部门已配合当地卫生健康部门在服务区、高速出入口、普通国省干线、客运站、客运码头共设置卫生检疫站2万余处，2月13日当天一线投入疫情防控人员约78万人。
全国通过铁路、公路、水运、邮政等运输方式向湖北地区运送防疫物资和生活物资24.44万吨，运送电煤、燃油等生产物资76.2万吨。
公路运输车辆向湖北运送医疗酒精、消毒液、医疗器械、口罩、测温仪、应急帐篷、防护服等疫情防控物资及相关生活物资13.1万吨。
国家铁路集团累计装运防控保障物资5625批、7.08万吨，其中防疫物品4328批、1.32万吨。
中国邮政集团组织开行邮政车11.2万班次、直飞武汉专机19架次，共计运送口罩、药品等防疫物资3631吨。
武汉水域共累计保障载运重点物资船舶230艘次，保障运输电煤64.6万余吨、燃油11.6万余吨、粮食3.9万余吨。
2月13日，物流保障办公室发出3项紧急运输任务指令，通过铁路、公路运输方式运输新冠病毒核酸检测科研物资、医疗废物处置设施。截至2月13日，物流保障办公室受理的各部委、各省提出的应急运输保障工作98项，共下达紧急运输指令95项，累计运输货物2.09万吨。
民航系统共保障10847个航班，运送防控物资168.5万件，累计14218.49吨；累计运输人员28229人次，其中运送医护人员26001人次，接回滞留海外旅客1185名，运输1043名滞留湖北的旅客出境。
